Основан през 1956г, Археологическият музей в Несебър е с първа експозиция в църквата "Св. Йоан Кръстител". В сегашната си сграда музеят е настанен през 1944 г. В музеят е разположена експозиция наречена "Несебър през вековете", в която са изложени експонати, паметници на културата и илюстрации от Месемврия и Средновековен Несебър. В музеят се намира Дипломата, с която се удостоверевя, че Старият град Несебър е в списъка на Юнеско на световното културно наследство.